Ponente
Descripción
La inferencia de los tiempos evolutivos es parte fundamental de los estudios filogenéticos. Los métodos tradicionales no consideran la coevolución de los distintos elementos de las secuencias biológicas (epistasis). Esta simplificación, motivada por la dificultad de los cálculos, puede conducir a resultados imprecisos. En el presente trabajo se desarrolla un método de inferencia de los tiempos evolutivos, que toma en consideración la coevolución. Se propone un proceso de Ornstein-Uhlenbeck como modelo de evolución de secuencias continuas en un árbol, que permite tomar en consideración la correlación de los distintos elementos de estas. Se utiliza un enfoque de máxima verosimilitud para inferir los tiempos evolutivos, a partir de las secuencias observadas en las hojas del árbol filogenético. Se caracteriza estadísticamente el rendimiento de la metodología propuesta y se extiende al caso de secuencias discretas, de mayor relevancia para las aplicaciones biológicas. En este caso las secuencias se describen mediante un modelo de Potts. Se demuestra que es posible inferir los tiempos evolutivos de forma precisa con la metodología desarrollada y que considerar el efecto de las correlaciones entre los elementos de las secuencias es fundamental para esta inferencia.
